Protein–RNA interactions for Protein: O75955

FLOT1, Flotillin-1, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLOT1O75955 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FLOT1O75955 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FLOT1O75955 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms