Protein–RNA interactions for Protein: O75607

NPM3, Nucleoplasmin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPM3O75607 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NPM3O75607 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NPM3O75607 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NPM3O75607 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NPM3O75607 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NPM3O75607 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPM3O75607 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NPM3O75607 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NPM3O75607 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NPM3O75607 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NPM3O75607 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NPM3O75607 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NPM3O75607 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NPM3O75607 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms