Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ITGA10O75578 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ITGA10O75578 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms