Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CTSVO60911 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CTSVO60911 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CTSVO60911 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CTSVO60911 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms