Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FOXO3O43524 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FOXO3O43524 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms