Protein–RNA interactions for Protein: O43405

COCH, Cochlin, humanhuman

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Length 550 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COCHO43405 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
COCHO43405 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
COCHO43405 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COCHO43405 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
COCHO43405 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
COCHO43405 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
COCHO43405 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
COCHO43405 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
COCHO43405 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
COCHO43405 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
COCHO43405 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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