Protein–RNA interactions for Protein: O43312

MTSS1, Metastasis suppressor protein 1, humanhuman

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Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1O43312 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
MTSS1O43312 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
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MTSS1O43312 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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MTSS1O43312 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MTSS1O43312 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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