Protein–RNA interactions for Protein: O43292

GPAA1, Glycosylphosphatidylinositol anchor attachment 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAA1O43292 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
GPAA1O43292 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GPAA1O43292 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms