Protein–RNA interactions for Protein: O43147

SGSM2, Small G protein signaling modulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM2O43147 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SGSM2O43147 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SGSM2O43147 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms