Protein–RNA interactions for Protein: O15551

CLDN3, Claudin-3, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3O15551 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN3O15551 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms