Protein–RNA interactions for Protein: O15504

NUPL2, Nucleoporin-like protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUPL2O15504 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
NUPL2O15504 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NUPL2O15504 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.2 ms