Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
VGFO15240 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VGFO15240 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
VGFO15240 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
VGFO15240 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
VGFO15240 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VGFO15240 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VGFO15240 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VGFO15240 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
VGFO15240 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
VGFO15240 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
VGFO15240 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
VGFO15240 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
VGFO15240 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
VGFO15240 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
VGFO15240 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
VGFO15240 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
VGFO15240 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VGFO15240 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
VGFO15240 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
VGFO15240 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
VGFO15240 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
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