Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHE40O14503 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
BHLHE40O14503 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms