Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PODXLO00592 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PODXLO00592 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PODXLO00592 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PODXLO00592 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms