Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NFKBIEO00221 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NFKBIEO00221 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NFKBIEO00221 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms