Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L20D6RJB6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L20D6RJB6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms