Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L18D6R9N7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L18D6R9N7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
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