Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
USP17L13C9JLJ4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
USP17L13C9JLJ4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms