Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ERVV-2B6SEH9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ERVV-2B6SEH9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ERVV-2B6SEH9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms