Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.33■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HMGB1P1B2RPK0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms