Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOBPA7XYQ1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SOBPA7XYQ1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
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