Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP27XA6NNY8 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms