Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RGPD3A6NKT7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RGPD3A6NKT7 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms