Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CCDC182A6NF36 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CCDC182A6NF36 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms