Protein–RNA interactions for Protein: A6NDD5

SYNDIG1L, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNDIG1LA6NDD5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SYNDIG1LA6NDD5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SYNDIG1LA6NDD5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms