Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LCHNA4D1U4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LCHNA4D1U4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms