Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRAMEF22A3QJZ6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRAMEF22A3QJZ6 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms