Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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ARL2-SNX15V9GYD0 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ARL2-SNX15V9GYD0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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