Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNX9Q9Y5X1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SNX9Q9Y5X1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms