Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNFRSF18Q9Y5U5 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TNFRSF18Q9Y5U5 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms