Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E2

PCDHB7, Protocadherin beta-7, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB7Q9Y5E2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCDHB7Q9Y5E2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PCDHB7Q9Y5E2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms