Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.14
DCAF1Q9Y4B6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC40.88■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC40.88■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC40.88■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC40.88■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.85■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC40.85■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
DCAF1Q9Y4B6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC40.82■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.82■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC40.82■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC40.79■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC40.79■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC40.78■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC40.76■■■■■ 4.12
DCAF1Q9Y4B6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.75■■■■■ 4.11
DCAF1Q9Y4B6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC40.75■■■■■ 4.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms