Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
RAD54L2Q9Y4B4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RAD54L2Q9Y4B4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms