Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4A8

NFE2L3, Nuclear factor erythroid 2-related factor 3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2L3Q9Y4A8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NFE2L3Q9Y4A8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFE2L3Q9Y4A8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
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