Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HDGFL3Q9Y3E1 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HDGFL3Q9Y3E1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms