Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TMED7Q9Y3B3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TMED7Q9Y3B3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms