Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PRG3Q9Y2Y8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PRG3Q9Y2Y8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms