Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATF5Q9Y2D1 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ATF5Q9Y2D1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms