Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y210

TRPC6, Short transient receptor potential channel 6, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC6Q9Y210 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRPC6Q9Y210 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TRPC6Q9Y210 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms