Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMZ2

SYNRG, Synergin gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNRGQ9UMZ2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SYNRGQ9UMZ2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNRGQ9UMZ2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms