Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMS5

PHTF1, Putative homeodomain transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 762 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHTF1Q9UMS5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHTF1Q9UMS5 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHTF1Q9UMS5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms