Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ3

BARX2, Homeobox protein BarH-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARX2Q9UMQ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BARX2Q9UMQ3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BARX2Q9UMQ3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms