Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM54

MYO6, Unconventional myosin-VI, humanhuman

Predictions only

Length 1,294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO6Q9UM54 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MYO6Q9UM54 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MYO6Q9UM54 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms