Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZNRF3Q9ULT6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNRF3Q9ULT6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNRF3Q9ULT6 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms