Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LRFN2Q9ULH4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LRFN2Q9ULH4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms