Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC31.65■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
INO80Q9ULG1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC31.64■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC31.57■■■□□ 2.65
INO80Q9ULG1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
INO80Q9ULG1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms