Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
DSEQ9UL01 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DSEQ9UL01 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DSEQ9UL01 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms