Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CROTQ9UKG9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CROTQ9UKG9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms