Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
MRTO4Q9UKD2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
MRTO4Q9UKD2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms