Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TUBE1Q9UJT0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBE1Q9UJT0 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms